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Nucleic Acids Res|北大崔庆华团队发表最新TransmiR v3.0数据库,包含更全面miRNA转录调控信息

测序中国  · 公众号  ·  · 2024-11-20 11:50

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microRNA(miRNA)是一类重要的转录后调控因子,其在各种组织中表达,并参与不同生理和病理过程。一些miRNA在疾病中的功能已得到充分表征,但人们对miRNA基因转录调控和失调机制的了解仍然相对有限。miRNA独特的生物发生过程为其转录调控分析带来了挑战,因此整理经实验验证、能代表转录因子(TF)和miRNA之间真正功能性相互作用的调控信息十分重要。 2010年, 北京大学崔庆华研究团队 及合作者基于已发表的人工筛选TF-miRNA调控关系构建了TransmiR数据库,并于2018年进行了显著更新推出TransmiR v2.0。TransmiR v2.0包含3,730个TF-miRNA调控关系,涉及约623个TF、约785个miRNA、19个物种和1,349篇出版物;并提供了5个物种中基于ChIP-seq数据的1,785,998个TF-miRNA调控关系。 近日,崔庆华团队在 Nucleic Acids Research 发表了题为“TransmiR v3.0: an updated transcription factor-microRNA regulat ………………………………

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