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基于FeaturePlot参数调优及ggplot2美化

生信漫漫学  · 公众号  ·  · 2024-11-14 09:11

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前情提要 上周整理了 FeaturePlot可视化及常用参数浅析 上篇推文中,一起 基于PBMC3k的示例数据了解了一下FeaturePlot可视化的结果,以及常用参数 那这期基于常用参数以及ggplot2去美化一下FeaturePlot结果。 FeaturePlot结果数据 美化结果图之前,我们先来看看 FeaturePlot绘图得到的结果数据都有什么内容 p  < - FeaturePlot(sce.all.int, features =  "CD3D" ) 还是一样的, 将绘图结果保存为一个变量,就可以查看。 首先 class(p) 查看一下属性 结果显示 对象p是一个由patchwork包处理过的ggplot2图形对象,可能是由多个ggplot对象组合而成的复杂图形布局 。这种对象可以包含多个图层、主题、注释和布局设置,用于创建丰富的数据可视化。 绘图结果数据详情: 主要的数据存放在 data 里面,可以通过 View(p[[1]][["data"]]) 查看 data: 是一个数据框(data frame),包含了用于绘图的数据 ………………………………

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