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导语 人类胃肠道是一个复杂的系统,由多个器官组成,它们协同工作以吸收营养,同时提供免疫活性屏障。胃肠道疾病非常普遍:溃疡性结肠炎和克罗恩病影响全球超过700万人,每年新诊断的结直肠癌(CRC)病例有200万例。单细胞转录组学为胃肠稳态、发育和疾病提供了前所未有的分子见解。迄今为止,已经有多项单细胞研究对健康和患病状态下的胃肠道细胞结构进行了调查。这些研究有各自的流程和标记系统,这给外部研究人员使用它们带来了困难。 单细胞测序网讯 :11月20日,Wellcome Sanger研究所的Sarah A. Teichmann、Amanda J. Oliver等研究人员在 Nature 杂志以“ Single-cell integration reveals metaplasia in inflammatory gut diseases ”为题发表了一篇文章,研究人员开发了一种新工具(scAutoQC),整合了25个人类胃肠道 (GI) 单细胞数据集,生成了一份包含 160 万个细
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