空转|CARD-结合scRNA解决空间转录组spot注释，还能增强空间精度？！

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前面已经介绍过了Seurat 空转 | 结合scRNA完成空转spot注释（Seurat Mapping） &  彩蛋（封面的空转主图代码） 和 SPOTlight 空转 | 我，SPOTlight，用解卷积，解决空间转录组spot注释！ 联合单细胞进行空间转录组spot注释的方法，本文介绍下20202年发表于NBT的文献 Spatially informed cell type deconvolution for spatial transcriptomics 的 CARD 方法。 之所以在Seurat 和 SPOTlight外还要再介绍CARD，是因为在算法层面的区别外，CARD还额外以下几种使用场景： （1） Refined spatial map（ 提升空间图谱精度 ） （2） reference-free version: CARDfree （ 基于基因集合进行空间spot注释 ） （3） single cell resolution mapping （ 推断并绘制 单细胞水平的空间spot注释 ） 一 载入R包，数据  1.1，R包安装 安装CARD包，并加载 ### 安装CARD包 devtools::install_github('YingMa0107/CARD') ###加载CARD包 library(CARD) library(Seurat) library(pa ………………………………