免疫浸润分析，推断肿瘤微环境不同细胞比例（天花板工具: IOBR 2.0）

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动机 免疫疗法的日益应用突显了 肿瘤微环境(TME) 在影响治疗结果中的关键作用。测序技术的进步能从多个角度分析TME，获得新见解。多组学数据的复杂性和大量性给分析和解释带来了挑战。为了解决问题，推出了IOBR 1.0的升级版本 IOBR 2.0 ，作为集成工具，简化了多组学数据TME分析和可视化的过程。IOBR 2.0能系统地研究TME特征，并识别免疫治疗结果的生物标志物。 亮点 IOBR 2.0 提供了用于TME分析和生物标志物识别的流程  包含6个模块，用于RNA数据预处理、肿瘤微环境特征分析以及基因组-肿瘤微环境相互作用 集成了10种反卷积方法和322个与TME相关的基因特征  支持单细胞特征对批量RNA-seq数据表型分析 小结 大规模转录组数据集的使用极大地提高了对TME的理解，有助于开发精准的免疫疗法。多组学、scRNA-seq和空间转录组测序的日益应用带来了许多新见 ………………………………