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染色体由一个个核小体串联组成,呈高度压缩折叠状态,在转录翻译时部分染色质结构会打开,允许进行基因转录表达。这部分无核小体的裸露DNA区域被称为开放染色质或染色质可及区域。染色质开放性涉及到染色质结构的动态变化,这些变化允许转录因子和其他调控蛋白结合DNA,从而调控基因的表达。染色质开放性的改变与多种生物学过程密切相关,包括细胞分化、组织发育、疾病发生,尤其是癌症的发展。 目前市场常见的染色质可及性检测技术如DNase-seq、ATAC-seq等,需要通过酶切富集特定区域进行分析。Fiber-seq技术无需酶切,可以直接标记开放状态的DNA区域进行PacBio HiFi长读长测序,进而分析单个染色体纤维上的DNA序列并识别染色质可及区域,检测更准确。( 技术介绍:Fiber-seq实现一次HiFi测序解锁全方位组学图谱 ) 图1 Fiber-seq技术原理 [1] 01
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