主要观点总结
文章介绍了美国芝加哥大学研究团队开发的新的空间转录组方法Array-seq，该方法结合了经典的DNA微阵列和NGS技术，用于空间转录组学分析。该方法具有较大表面积、高通量、高灵敏度、定位特异性和低成本等优点，可用于从小鼠组织到整个人体器官的空间转录组学研究，并实现了组织样本的三维分析。
关键观点总结
关键观点1: 研究团队开发出新的空间转录组方法Array-seq，结合了经典的DNA微阵列和NGS技术。
该方法具有简单灵活的平台，可用于大规模的空间分子生物学研究。
关键观点2: Array-seq具有较大表面积，能够捕获大量细胞的空间转录组信息。
一张Array-seq载玻片可以捕获200万至2000万个细胞，主要取决于组织类型和要分析的组织切片的数量和大小。
关键观点3: Array-seq生成的数据质量高，能够检测基因、细胞类型和组织学区域。
该方法与H染色兼容，适用于所有基础和临床研究领域。
关键观点4: Array-seq可实现三维层面的高通量分析。
通过对小鼠肾脏的连续切片分析，验证了Array-seq在三维空间转录组分析中的有效性。
关键观点5: Array-seq可用于人类器官全视野切片分析。
通过对人类脾脏切片的分析，展示了Array-seq在人体组织样本分析中的潜力。
文章预览
研究组织中细胞和分子的空间组织结构是生物医学和临床病理学的一个基础性课题。近年来，空间转录组学（ST）的进展使得在组织切片特定区域进行转录组测序成为可能，并且出现了商业化平台，例如Visium。然而，现有的ST方法面仍存在可用表面积小、与苏木精和伊红（H ）染色兼容性差、低通量和高成本等局限性，阻碍了其在基础和临床研究中被广泛使用。 近日，美国芝加哥大学的研究团队在 Nature Methods 发表了题为“Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics”的文章， 报道了新开发的空间转录组方法Array-seq，其能够将经典的寡核苷酸微阵列重新应用到空间转录组学分析。 研究团队利用携带定制探针的微阵列生成Array-seq载玻片，这些探针包含已知空间坐标上独特条形码的共同序列，并在微阵列上的所有点产生mRNA捕获探针。 基于小
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