Nat Methods | 结合微阵列和NGS的可扩展空间转录组学方法Array-seq，突破空间分析界限

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研究组织中细胞和分子的空间组织结构是生物医学和临床病理学的一个基础性课题。近年来，空间转录组学（ST）的进展使得在组织切片特定区域进行转录组测序成为可能，并且出现了商业化平台，例如Visium。然而，现有的ST方法面仍存在可用表面积小、与苏木精和伊红（H ）染色兼容性差、低通量和高成本等局限性，阻碍了其在基础和临床研究中被广泛使用。 近日，美国芝加哥大学的研究团队在 Nature Methods 发表了题为“Repurposing large-format microarrays for scalable spatial transcriptomics”的文章， 报道了新开发的空间转录组方法Array-seq，其能够将经典的寡核苷酸微阵列重新应用到空间转录组学分析。 研究团队利用携带定制探针的微阵列生成Array-seq载玻片，这些探针包含已知空间坐标上独特条形码的共同序列，并在微阵列上的所有点产生mRNA捕获探针。 基于小 ………………………………