专栏名称: 生信分析手册
分析生信文献,学习生信分析知识,专注生信分析最前沿。
今天看啥  ›  专栏  ›  生信分析手册

4+分型+预后模型+单细胞+实验,非常适合新手模仿~

生信分析手册  · 公众号  ·  · 2024-12-13 18:00
    

文章预览

‍ 导语 今天给同学们分享一篇生信文章“Building a Risk Scoring Model for ARDS in Lung Adenocarcinoma Patients Using Machine Learning Algorithms”,这篇文章发表在 J Cell Mol Med 期刊上,影响因子为4.3。 结果: 急性呼吸窘迫综合征与肺腺癌预后的关系 通过TCGA‐LUAD结合GTEx和GEO的差异分析(logFCfilter = 1,fdrFilter = 0.05),共获得276个LUAD中ARDS相关差异基因,绘制热图和火山图(图1A,B)。结合生存状态和生存时间,对LUAD中ARDS相关差异基因进行单因素考克斯分析,共获得31个预后相关基因(图1C)。随后,基于预后基因的表达矩阵,绘制了它们之间的相关网络(图1D)。 一致性聚类分析 对LUAD患者的样本进行共识聚类分析,以确定ARDS敏感亚组。通过一致性聚类分析,将患者分为2个亚型。基于由共识矩阵生成的热图的图例,当K= 2时实现最佳结果(图2A-D)。进一步的主成分分 ………………………………

原文地址:访问原文地址
快照地址: 访问文章快照
总结与预览地址:访问总结与预览