Mol Cell | Predictomes——由AlphaFold建模的蛋白质互作数据库

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撰文 | 敏一 在结构生物学与系统生物学领域，全面解析 蛋白质相互作用 （protein-protein interactions， PPIs ） 的分子机制是理解生命过程的核心挑战。稳定的蛋白质相互作用参与形成大的细胞结构 （如核孔） 和稳定的分子机器 （如RNA聚合酶） ，而瞬时相互作用则涉及从信号传导到DNA复制的动态过程。人类基因组编码约20,000种蛋白质，理论上可形成约4亿种二元组合，但目前估计具有功能的PPIs约150万对，其中只有50,000对 （3%） 已被鉴定，约9,000对 （0.5%） 已实现了结构解析。 AlphaFold-Multimer （ AF-M ） 作为深度学习驱动的蛋白质复合体预测工具，为大规模PPIs预测带来了革命性突破 。然而，现有AF-M的置信度指标 （如avg_models、ipTM和pDockQ等） 在大规模筛选中难以区分真实相互作用与假阳性的预测互作，极大限制了其在生物学发现中的应用。 近日，来自哈 ………………………………