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如何从单细胞数据海洋中寻找调控基因?

基迪奥生物  · 公众号  ·  · 2024-12-11 18:02
    

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单细胞转录组庞大的数据量使得其数据挖掘难度要远高于普通转录组,正因如此,越来越多的单细胞转录组分析点也应运而生。在先前我们专门介绍了4个单细胞转录组的个性化分析点,分别是: 1)scWGCNA;2)拟时分析;3)细胞通讯分析;4)细胞周期分析 。我们可以简单总结这些分析点的侧重点: 1.scWGCNA:研究基因与基因之间的共表达特征; 2.拟时分析:研究细胞与细胞之间的分化关系; 3.细胞通讯:研究细胞与细胞之间的互作关系; 4.细胞周期:研究细胞自身的细胞分裂情况; 以上分析的侧重点基本落在细胞上,如果要研究细胞内部的分子机制从而解释特定生物学现象,不可避免的需要研究细胞中的基因表达情况。基因的表达模式可以分为3类: 1)稳健表达的管家基因;2)共表达的基因;3)相互调控的基因 。其中第2类的基因表达模式可以 ………………………………

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