热图联动点图展示Marker基因

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前情提要 最近在 #单细胞常见图表 会整理 五种方法可视化Marker基因系列 目前已经整理前两种—— Doheatmap以及Dotplot 可视化Marker基因及美化 在整理完 Dotplot可视化细节之如何计算百分比和表达量平均值 提到了文章中会使用Dotplot的结果，用热图的形式进行展示 ** 文章是 单细胞文献复现月更交流群（门票99哦） 里面复现的第一篇，胃癌的文章。 那这期一起来学习尝试复现一下，文章使用的里面展示Marker基因的方式。 获取绘图数据 获取需要展示的Marker基因集 这里使用 Pbmc-3K的数据 进行尝试，首先还是 注释后的数据集，使用FindAllMarker计算每个亚群的Marker基因，并获取Top5的Marker基因用于后续的展示 #计算所有簇的Marker基因，并且可视化TOP5基因 # only.pos = TRUE，只关注上调；min.pct = 0.25，一个基因至少要在25%的细胞中表达 pbmc.markers  < - FindAllMarkers(pbmc, o ………………………………