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华大、斯坦福等取得时空算法重大突破,绘制小鼠胚胎发育的“3D分子全息图”,有助于发育、疾病等研究

生辉  · 公众号  ·  · 2024-11-12 19:33

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空间转录组学技术,尤其是华大时空组学技术 Stereo-seq 的出现,能够准确反映细胞的空间排布和 RNA 的原位表达,帮助科研人员从时间和空间维度上认知每个基因、每个细胞,有望带来生命科学领域的第三次科技革命,成为重新认知器官结构、生命发育、物种演化和定义疾病的底层工具。 对于时空组学技术生产的原始数据,需结合算法工具进行处理、分析,进而找到在空间分布上具有意义的细胞和基因表达。然而,由于该技术的创新性,现有工具包大多仅侧重于空间原位信号的可视化,而缺乏系统性分析数据的方法。 北京时间 11 月 12 日,华大生命科学研究院联合斯坦福大学医学院、武汉大学电子信息学院等机构在国际顶级学术期刊《细胞》( Cell )发表时空算法工具包最新研究。 该国际协作团队借鉴了物理学、地理学、经济学等多个跨学科领域 ………………………………

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