厦门大学JCTC | AlphaTraj：基于子口袋的蛋白质口袋动力学分析软件

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英文原题： Subpocket-Based Analysis Approach for the Protein Pocket Dynamics 通讯作者： 曹泽星（厦门大学） 作者： Nan Lv（吕楠）and Zexing Cao（曹泽星）* 蛋白质口袋的结构和动态性质显著影响其生物功能，对酶工程和新药研发至关重要，目前已有一些软件工具用于蛋白质口袋性质分析。在蛋白质动力学弛豫过程中，由于其口袋信息的复杂性和多样性，合理描述口袋的动态结构与演化特性还需要分析方法的进一步完善与发展。 厦门大学曹泽星 教授课题组 基于分子动力学轨迹，提出并测试了计算分析口袋动态性质的策略，开发了名为AlphaTraj的软件工具。 该方法将整个蛋白质口袋划分成若干子口袋，并检测这些子口袋的各种性质，如存活时间、稳定性和相关性。与当前其他类似平台工具相比，该方法提供了对蛋白质口袋动态演变更高分辨率的定量表征。在此基础 ………………………………