科普：10X Genomics单细胞转录组技术

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有观点，有态度 这是生命科学产业观察公众号的第 1168-2 期文章 来源：分子庄园 1、10X genomics 10X genomics是把微珠加DNA标签、微滴发生、酶反应和高通量测序后的数据分析这一系列的技术整合在一起的一个基于微流控技术和油包水乳浊液酶反应原理的分子生物学分析系统。 2、凝胶微珠(Gel Beads) Gel bead由凝胶磁珠和其上的一段引物构成，每个凝胶微珠上有40-80万特定的核酸引物序列。 微珠上的引物序列构成依次为： a.全长Illumina TruSeq Read 1测序引物。 b.16nt 10X Barcode序列，每个Gel bead的10X Barcode均不相同，形成GEM后用于区分细胞。任意两个barcode之间至少差2个或2个以上的碱基（避免误读）。 c.12nt UMI，一段12nt的随机序列，区分同一细胞的不同转录本并去除PCR Duplications，实现绝对定量。 庄主推荐： Duplication的从何而来？ 每个DNA分子都将有自己的UMI序列， ………………………………