nextPYP：单颗粒cryo-ET成像的原位蛋白质异质性解析平台

文章预览

加 星标 ，再也不怕错过更新！方法见文末动图。 冷冻电镜断层扫描 （Cryo-ET） 是一种新兴技术，通过在原位、冷冻状态下拍摄一系列标本的倾斜图像，揭示蛋白质的结构以及异质性。特别是单颗粒冷冻电镜断层扫描 （SP-CET） ，可以绘制高分辨率图谱，成功应用于体外重组生物系统和细胞内亚细胞复合物的研究。目前如冷冻聚焦离子束 （Cryo-FIB） 样品制备和光束-图像偏移并行数据采集，大大提高了数据采集效率。然而，数据处理仍面临挑战，复杂的程序和高计算要求使得进展缓慢。优化的SP-CET策略虽然节省了存储空间，但在实际应用中仍存在瓶颈，缺乏统一的数据处理平台使得不同步骤的组合受到阻碍。 为了克服这些挑战，2023年10月 Nature Methods 介绍了一篇题为 “nextPYP: a comprehensive and scalable platform for characterizing protein variability in situ using single-p ………………………………