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如何做好RNA速率时序分析,怎么给他加戏——很值得学习的代码和思路

生信钱同学  · 公众号  ·  · 2024-06-16 17:06
    

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不设置🌟有时会收不到公众号内容,code一段时间后会失效 需要的小伙伴们请及时到 文末 领取今日的code 如果你想做一个非常好的拟时序,RNA速率分析的话,你就好好看看这篇文章。RNA velocity联合基因模块分析很值得咱们去学。重点介绍下TopicVelo,文章的方法部分,放了很大的篇幅在讲如何做好这一部分。其优势就是TopicVelo方法在分析RNA速度时,能够有效解开复杂的、多分支的系统中 不同基因程序 的动态过程。 亮点 单独看RNA velocity和基因模块分析都很常见,但是他们两个联合能产生什么样的结果,以及该怎么解读他,却很少见,很值得学习。 代码部分很细致,示例数据,中间过程以及代码注释写的都很清楚 这是一些常规的单细胞分析流程,我就不多放了 这个文章用了 seurat V5,想学习 v5流程的可以跟着这篇文章走 识别骨髓前体细胞中的Eomes表 ………………………………

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