Nat Mach Intell | 识别肿瘤新抗原-物理启发的Sliding-Transformer神经构架

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肿瘤新抗原研究的进展加速了肿瘤免疫疗法的开发，包括癌症疫苗、过继细胞疗法和抗体疗法。新抗原由肿瘤细胞基因突变产生，能激活T细胞反应，具有强免疫原性和肿瘤异质性。新一代测序和人工智能技术的进步使得快速识别和预测肿瘤新抗原成为可能。然而，识别引发强大T细胞免疫反应的新抗原仍然像大海捞针：其涉及三种高度多态性生物序列 （TCR/抗原/HLA） 的复杂相互作用，需要从大量序列组合中筛选出真正结合的TCR-抗原-HLA三元组；其次，构建物理上可解释且数据高效的预测方法对于增强对人类免疫反应的理解至关重要；此外，生物序列在个体中差异大，模型如何捕获残基相互作用内在模式并泛化到罕见的序列是一个重要问题。目前，仍缺乏全面的解决方案。 2024年9月27日，华东理工大学药学院、华东师范大学药学院、人工智能新药创智 ………………………………