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今天给大家介绍一篇仅用43天征服审稿人的文章,惊呆了老铁 文章来自期刊: Cancer Immunology Immunotherapy(IF4.6,中科院2区) 背景摘要 树突状细胞(DCs) 被发现与癌症的预后和生存有关,这篇文章首先通过单细胞数据剖析了ESCC肿瘤的微环境,随后通过Scissor方法,识别了Scissor+DCs和Scissor-DCs亚型,再整合bulk队列构建了一个针对食管鳞状细胞癌(ESCC)的Scissor+DC细胞预后模型。并通过招募40名ESCC临床患者进一步验证了风险预测模型的可靠性。并可能有助于开发针对ESCC的靶向或个性化疗法。 数据使用 单细胞队列:GSE160269 Bulk 队列:GSE53625 TCGA -ESCC 结果 1、ESCC单细胞RNA数据整合与聚类 为了研究食管鳞状细胞癌(ESCC)的细胞异质性,对ESCC单细胞队列GSE160269进行降维聚类可视化(图1A) 以及细胞注释得到了38个亚群(图1B)。分别为上皮细胞(亚群5、7、10、1
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