专栏名称: Biomamba 生信基地
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一文学会pheatmap热图绘制

Biomamba 生信基地  · 公众号  ·  · 2024-10-27 09:05

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往期回顾 此前我们也花过几篇推送的篇幅初步介绍了热图绘制方法 三行命令搞定热图 热图绘制2.0 给你安排一个懂生信的工具人(四):手把手教你用在线 pheatmap 绘制热图 ComplexHeatmap学习手册 这次推送制作了视频带领大家如何熟练地用pheatmap去绘制一张满意的热图: 视频教程(也可点击文末原文链接跳转): https://www.bilibili.com/video/BV1RT4y1Q7kX/ 代码如下: if (! require (pheatmap))install.packages( 'pheatmap' ) ## Loading required package: pheatmap library (pheatmap) test = matrix(rnorm( 200 ), 20 , 10 ) test[ 1 : 10 , seq( 1 , 10 , 2 )] = test[ 1 : 10 , seq( 1 , 10 , 2 )] + 3 test[ 11 : 20 , seq( 2 , 10 , 2 )] = test[ 11 : 20 , seq( 2 , 10 , 2 )] + 2 test[ 15 : 20 , seq( 2 , 10 , 2 )] = test[ 15 : 20 , seq( 2 , 10 , 2 )] + 4 colnames(test) = paste( "Test" , 1 : 10 , sep = "" ) rownames(test) = paste( "Gene" , 1 : 20 , sep = "" ) test[ 1 : 5 , 1 : 5 ] ………………………………

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