专栏名称: 遇见生物合成
1)简述国内外合成生物学与天然产物生物合成相关研究进展,解读最新文献资讯;2)简述学术界那些事,偶尔情怀主义;3)化学与生物学的完美碰撞;4)高校与研究所那些事。
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江南大学倪晔/许国超组Nat Comm|机器学习增强羧酯酶的立体选择性发散进化

遇见生物合成  · 公众号  ·  · 2024-10-22 15:02
    

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遇见/摘要 羧酯酶是手性羧酸和酯类对映体选择性合成的有效生物催化剂。对于近对称酯类化合物,天然的羧酯酶对映选择性表现较差。虽然机器学习能有效加快定向进化,但由于缺乏预测羧酯酶对映体选择性的模型,阻碍了研究的进展,主要难点是高质量的训练数据集的获得。在本研究中,利用高通量筛选获的高质量的数据集,训练出梯度提升的回归树模型,以促进立体选择性进化,获得了立体选择性互补的突变体。 遇见/内容 酶在合成生物学和生物催化领域引起了相当大的关注,被广泛誉为光学活性化学品生物合成的首选。酶在活性中心内立体化学结构通常表现为独特的空间、疏水和静电特性,构成了高立体选择性的基础。然而,在对于具有几乎对称结构的底物时,酶在保持高立体选择性方面面临挑战。手性环己 -3- 烯 -1- 羧酸( CHCA )具有一 ………………………………

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