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给初学者的忠告,不要拿一套垃圾数据入门!

生信技能树  · 公众号  ·  · 2018-05-10 20:54

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圾数据对初学者的伤害真的很可怕!——jimmy 今天有一个常年潜水的粉丝突然找我聊天,说自己心态崩了,觉得自己不适合做数据处理,一年多了,感觉自己其实是一事无成。 让我 又一次 想起了当年自己入门的各种凄惨惨戚戚! 碱基质量值很差,GC不平衡,还有接头,PCR重复也很多,kmer值也很诡异,时间都耗在QC上面了,结果几个月下来,一个流程都没搞明白,各种查资料,还是在原地打转。 做个转录组类似的找差异基因的,实验设计者不设计重复,一个case,一个control,搞毛线呀! 即使有重复,组内相关性极差,还不如对照。 而且各个样本量测序极其不一致,头大。比对效率低的惊人,让你怀疑人生,是不是参考基因组用错了?或者是垃圾物种,连个参考 ………………………………

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