医学博士,R语言及Python爱好者,科研方向为真实世界研究,生信分析与人工智能研究。
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renv包-R 语言数据分析可重复的利器

灵活胖子的科研进步之路  · 公众号  · 科技自媒体  · 2024-08-06 00:30
    

主要观点总结

本文介绍了renv包的功能和使用方法,帮助R项目创建可重现的环境,提供隔离、可移植和可重现性。包括安装、工作流程、教程、基础设施、警告和卸载等方面的内容。

关键观点总结

关键观点1: renv包的功能

renv包可帮助R项目创建可重现的环境,提供隔离、可移植和可重现性,使不同项目可以使用不同版本的包,并且安装和升级软件包能记录在锁文件中,便于在新机器上运行或与他人共享代码。

关键观点2: renv包的工作流程

使用renv包需要先初始化项目,建立项目库,记录所有当前使用的包。然后安装和升级软件包,确认代码按预期工作后,将软件包及其源代码记录在锁定文件中。分享或在新机器上运行代码时,可以恢复锁定文件中的特定包版本。

关键观点3: renv教程和基础设施

renv提供教程和基础设施支持,包括lock文件、库和存储库的概念,以及协作、安装包、更新包、基础设施等方面的指导。同时也介绍了一些renv无法帮助解决的问题,如R版本问题、Pandoc问题、操作系统和系统库版本等。

关键观点4: 卸载renv

如果renv不适合项目,可以停用和卸载。使用renv::deactivate()停用renv,使用utils::remove.packages("renv")卸载软件包。


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